濒危物种天目铁木根部宏基因组的.docx
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医药学院
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摘 要
天目铁木(Ostrya rehderiana Chun)是桦木科(Betulaceae)铁木属(Ostrya)的,位于浙江省西天目山,是我国一级濒危保护植物,现在仅存 5 株野生个体,形式相当严峻。为研究植物根际土壤微生物的群落组成、结构及功能,探究其生物多样性和功能多样性,采集野生天目铁木、人工林移栽的天目铁木及天目山优势树种柳杉的根际土壤样本后,通过宏基因组 16S rDNA 扩增子和 ITS rDNA 扩增子测序,分析各微生物样本的丰度及其多样性水平,野生天目铁木根际土壤样本(W_Or)和人工林天目铁木根际土壤样本(C_Or)的真菌菌属物种分布更接近,群落构成差异最小。细菌多样性相似性较高;而W_Or 和柳杉根际土壤样本(C_fH)真菌菌属的物种多样性相似性较高。 W_Or和 C_fH的细菌菌属物种分布更接近,群落构成差异最小,分布结构相似度比较高。发现像嗜纤维菌(Cytophaga) 、红细菌属(Rhodobacter) 、食酸菌属(Acidovorax) 和Meyerozyma等菌属在野生天目铁木和人工林移栽的天目铁木的根际土壤中都不存在,而在优势树种柳杉中能找到。这些菌属可能对天目铁木的生长起很大的促进作用。可以分析根际微生物与天目铁木致濒相关性。
目录
引言
6
1. 天目铁木的现状
6
1.1. 天目铁木的濒危状况
6
1.2. 天目铁木的保护性措施
6
2. 宏基因组学概况
6
3. 根际土壤微生物与植物的关系
6
3.1. 植物生长影响根际微生物
7
3.2. 根际微生物影响植物生长
7
4. 天目铁木根际菌群分析
7
4.1. 材料与方法
7
4.1.1. 采样和处理
7
4.1.2. PCR扩增、纯化和测序
7
4.2. 结果与分析
8
4.2.1. 序列结果
8
4.2.2. 物种在门水平及属水平上的分布状况
9
4.2.3. 物种相关性结果
11
4.2.4. 根际微生物功能研究分析
12
4.2.5. Alpha Diversity
13
4.2.6. 系统进化关系展示
17
4.2.7. Beta多样性指数
17
4.3. 讨论
23
4.3.1. 微生物结构分布
23
4.3.2. 微生物功能
23
参考文献
24
致谢
25
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